市農業委員會（市委農工委）設26個內設機構：
（一）辦公室（黨委辦公室）
負責機關文電、會務、機要、檔案、保密、信訪、政務公開、信息服務等制度建設、綜合協調和督促檢查工作；承擔重大突發事件應急綜合管理有關工作；負責人大代表提案和政協委員建議辦理有關工作；負責委機關和委黨委日常工作。
負責人：翁慶
（二）人事處
負責機關機構編制、人事管理、勞動工資、教育培訓等工作并指導所屬事業單位的上述工作；擬訂農業系統人才隊伍建設規劃，并會同有關部門指導實施；配合有關部門開展農業系列專業技術職務任職資格評審推薦、組織開展農民技術職稱評審推薦工作；參與農村實用人才培訓工作；會同有關部門承辦農業行業職業技能鑒定、技工技術等級考核工作。
負責人：陳太明
（三）宣傳處
擬訂農業、扶貧宣傳工作計劃、方案，并組織實施；指導機關和所屬事業單位的宣傳工作；圍繞農業農村工作和扶貧工作重點和中心任務組織專題宣傳報道；總結并宣傳農業及農村工作的重大舉措和典型經驗；承擔農業新聞發布和對外宣傳工作；配合有關部門管理委屬出版物工作；承擔委屬宣傳的對外聯絡和對內協調工作。
負責人：宋家玲
（四）計劃財務處
擬訂農業固定資產投資規模和方向、基地建設、技術改造等項目的規劃、計劃，提出市級支農財政資金安排建議；負責農業各產業重點項目的綜合平衡、申報審核，提出立項建議并監督實施；提出有關農業農村經濟發展的財政、稅收、信貸和保險等政策建議；編報部門預算、決算并組織執行；負責機關和所屬事業單位的財務會計制度建設、資金（資產）管理與監督以及績效評價工作；負責住房增量、公積金核算管理、發放機關職工工資、計提各項基金等工作，并指導所屬事業單位的上述工作；提出機關和所屬事業單位財政性資金使用的建議并組織實施；負責機關和所屬事業單位農業財政預算資金、專項資金、項目資金的管理與；指導和監督所屬事業單位財務、國有資產和政府采購管理工作；指導農業行業財務會計工作。
負責人：鄧艷
（五）審計處（項目監督辦公室）
承擔委系統（機關和所屬事業單位）財政財務收支、資產、負債、損益及所有者權益等經濟活動審計；依法開展委系統（機關和所屬事業單位或農業系統）基本建設工程概算（預算）、結算審計和固定資產投資項目的事前、事中及事后監督審計；依照有關規定，實施機關內設機構和所屬事業單位領導任期經濟責任審計；承擔委屬企、事業單位經濟合同執行情況審查、經濟效益評估及相關審計工作；依法開展專項審計調查和內部經濟制度執行情況督查；協調配合行業審計工作；組織監督檢查全市扶貧計劃、扶貧資金的落實于使用情況，糾正違規行為；配合有關部門開展扶貧資金審計和財務監督工作；負責全市涉農項目的監督管理工作。
負責人：羅舜
（六）政策法規處（市農村固定觀察點辦公室）
承擔農業法制建設的、農業行政執法能力建設和農業行政執法監督、檢查；組織農業法律、法規的宣傳、普及；指導全市農業綜合執法（相對集中行政處罰權）和農業行政許可工作；編報地方性農業法規、規章及規范性文件立法調研起草和修改工作；承擔農委系統規范性文件合法性審查和備案；承擔全市農業和農村工作的內部聯絡和綜合協調；組織開展調查研究并提出農業保護政策意見和建議；參與農業農村有關政策執行情況的督促檢查；承擔農村經濟與社會發展預測及綜合統計工作；起草農業農村工作、農村經濟與社會發展綜合性文件；提出處理農村改革和發展重大問題的原則和措施的建議；承擔市委農工委辦公室日常工作；指導全市農村固定觀察點工作。
負責人：劉瑜（副處長主持工作）
（七）農村經濟經營管理處（市農業產業化辦公室）
提出推進農業產業化發展政策建議，擬訂發展規劃和年度計劃并組織實施；提出穩定和完善農村基本經營制度的政策建議；指導農村土地承包、耕地使用權流轉和承包糾紛仲裁管理工作；指導農業產業化經營與發展；指導農村集體資產和財務管理工作；指導、監督減輕農民負擔和村民籌資籌勞管理工作；指導農業經濟行業協會工作；參與農村綜合改革有關工作。
負責人：周永一（副處長主持工作）
（八）新農村建設與社會發展處
提出有關社會主義新農村建設與農村社會事業發展政策建議，擬訂中長期規劃和年度計劃并組織實施；承擔全市新農村建設綜合協調和督查指導工作；組織開展新農村建設試點、示范建設；參與農村社會事業發展、基層組織建設、精神文明建設和民主法制建設；參與農民文化體育、農村“計生三結合”、機關定點幫扶等工作。
負責人：潘陸（副處長主持工作）
（九）科技教育處
提出農業科技發展政策建議，擬訂中長期規劃和年度計劃，并組織實施；承辦農業產業技術體系、農技推廣體系建設相關工作；指導和實施農業科技創新、技術推廣及農業重大科研項目，綜合協調農業產業技術開發、科技成果轉化及示范推廣工作；承擔農業科技成果管理、農業轉基因生物生產加工行政許可及監督管理工作；依法實施農業知識產權、農業動植物新品種保護和外來物種管理；指導農村干部、農業職業教育、農民從業技能和農村勞動力轉移就業培訓工作；組織實施“陽光工程”、“雨露計劃”的農村勞動力培訓和轉移就業工作。